Informatik
Refine
Document Type
- Bachelor Thesis (26)
- Master's Thesis (15)
- Preprint (2)
- Diploma Thesis (1)
Has Fulltext
- yes (44)
Is part of the Bibliography
- no (44)
Keywords
- Neuronales Netz (3)
- Applikation (2)
- Datenanalyse (2)
- Kolorektalkarzinom (2)
- Maschinelles Lernen (2)
- Simulation (2)
- 3D-Ultraschall (1)
- Algorithmus (1)
- Alzheimer (1)
- Analyse , Datenqualität , Krebsregister (1)
Institute
- Informatik (44)
Wird bei einem Patienten mit Kolorektalkarzinom der Tumor erfolgreich entfernt, beginnt die Nachsorgephase. Der Nachsorgeplan, welchen die Patienten bei der
Entlassung erhalten, orientiert sich an der S3-Leitlinie des Leitlinienprogramms für Onkologie. Der Patient kann selbst entscheiden, wo die Nachsorge stattfinden wird. Entweder lässt er seine Nachsorgeuntersuchungen in der Klinik durchführen (klinikinterne Nachsorge) oder er sucht einen niedergelassenen Onkologen auf (klinikexterne Nachsorge). Gegenstand dieser Arbeit ist die Analyse der klinikinternen und
-externen Nachsorge in Bezug auf die Einhaltung der S3-Leitlinie. Ziel ist es, festzustellen, ob anhand der erhobenen Daten Rückschlüsse auf die Leitlinientreue in Bezug auf die Nachsorge der Patienten gezogen werden kann. Im Rahmen dieser Thesis werden Patienten mit einem UICC-Stadium II oder III und einem Diagnosedatum zwischen 2009 und 2013 betrachtet. Basierend auf den Kriterien wurden 562 Datensätze aus dem GTDS exportiert. Nach anschließendem Bearbeiten und Aussortieren wurden 426 Patienten analysiert. Im seit 2001 in Heilbronn eingesetzten Gießener Tumordokumentationssystem (GTDS) werden die Falldaten der Tumorpatienten dokumentiert und gespeichert. Die Verlaufsdaten der
TNM-Dokumentation werden mindestens einmal jährlich zu den Patienten erhoben. Diese Daten werden analysiert, um die Leitlinientreue zu überprüfen.
Der Vergleich zwischen S3-Leitlinie und vorgenommenen Untersuchungen kann sich aufgrund lokaler Dokumentationspraxis nur auf den zeitlichen Ablauf der Untersuchungstermine beschränken, da im GTDS keinerlei Informationen zu der Art der vorgenommenen Untersuchung vorliegen. Um die zeitlichen Abläufe zu analysieren, werden aus den vorliegenden Datumswerten für jeden Patient ein Pfad bestehend aus Zuständen (Tumorfreiheit, Untersuchung 1, etc.) gebildet. Die Übergangswahrscheinlichkeiten
stellen einen Indikator für die Termintreue der Patienten dar. Es wurden 146 Patienten klinikintern und 149 Patienten klinikextern behandelt. 131 Patienten erhielten eine gemischte Nachsorge. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass die Informationen aus dem GTDS nicht ausreichen, um eine Leitlinienkonformität der Nachsorge von Kolorektalkarzinompatienten nachzuweisen, da im GTDS ausschließlich der Tumorverlauf dokumentiert wird, aber nicht, wie sich die Nachsorge im Speziellen gestaltet.
Ziel dieser Bachelorthesis ist es, den Datenbestand des Klinischen Krebsregisters am
Tumorzentrum Heilbronn-Franken auf seine Vollständigkeit, Vollzähligkeit und seine
Repräsentativität zu untersuchen.
Diese werden am Beispiel des Kolorektalen Karzinoms untersucht.
Folgende Fragen lassen sich formulieren:
• Lassen sich mit den in einem einrichtungsbezogenen klinischen Krebsregister, wie
dem am Gesundbrunnen Heilbronn, erhobene regionale Daten ggfs. überregionale und
eventuell sogar bundesweite Aussagen ableiten?
• Sind die erfassten Daten vollständig bzw. wie vollständig sind die Datenbestände der
registrierten Patienten?
• Sind die erfassten Daten im Tumorzentrum Heilbronn-Franken am Gesundbrunnen
Heilbronn vollzählig? Werden im Klinischen Krebsregister der SLK-Kliniken alle
Neuerkrankungen erfasst?
An architectural concept for implementing the socio-technical workflow of Digital Pathology in Chile
(2014)
Virtual Microscopy opens up the possibility to remotely access high quality images at large scales for scientific research, education, and clinical application. For clinical diagnostics, Digital Pathology (DP) presents a novel opportunity to reduce variability [Bauer et al., 2013] due to the reproducible access to Whole Slide Imaging, quantitative parameters (e.g. HER2 stained membrane) [Al-Janabi et al., 2012], second opinion and Quality Assurance [Ho et al., 2013]. Despite of the mentioned advantages, the challenge remains to incorporate DP into the pathologists workflow within a heterogeneous environment of systems and infrastructures [Stathonikos
et al., 2013]. Different issues must be solved in order to optimize the impact of DP in the daily clinical practice [Daniel et al., 2012] [Ho et al., 2006]. The integration needs precise planning and comprehensive evaluation for adopting this technology
[Stathonikos et al., 2013]. This thesis will focus on an organizational development approach based on a Socio-Technical System (STS). The socio-technical approach covers: (i) the technical issue: tissue-scanner, NDP.view, NDP.serve, analysis software, and (ii) the social issue: pathologists, technicians. In order to improve the integration, a joint optimization (of i and ii) is necessary. The developed STS approach will optimize the integration of DP towards improved workflows in clinical environments. The improved workflows will reduce the pathologists turnaround time, improve the certainty of the diagnostics, and provide a more effective patient care within the covered institutions. An overt multi-site Participatory Observation, Questionnaires, and Business Process Modelling Notation will be used to analyse the existing pathological workflows. Based on this, the system will be modelled with the 3lgm2 Toolkit [Winter et al., 2007] under consideration of various technical subsystems that are present in the clinical environment. Afterwards, the interfaces between subsystems and its possible interoperabilities will be evaluated, taking into account the different existing standards and guidelines for image processing and management, as well as business processes in DP. In order to analyse the existing preconditions a questionnaire will be evaluated to establish a robust and valid view. In addition, the overt participatory observation will support this elevation, giving a deeper insight on the social part. This observation also covers the technical side including the whole pathological process. The socio technical model will then reveal measurable potential for optimization with incorporated DP (e.g. higher throughput for slides). The organizational development approach consists of a Socio-Technical System based on overt multi-site participatory observations, questionnaires, business process modelling and 3LGM2, will optimize the use of Digital Pathology in the daily clinical practice and raise the acceptance to incorporate integrate the new technology within the dayly workflow through the user centred process of incorporation.
• Perform and evaluate a questionnaire and a participant observation of pathologists work days in private & public institutions
• Create and evaluate a 3lgm2 model
• Model the current pathological process (viewpoint of pathologist & technical assistant) & perform and evaluate a contextual inquiry to elevate the pathologists requirements & expectations towards the system
• Test the future WF according the model parameters.
This project will detect unsuspected interrelations and interdependencies within the socio- technical workflow with a pathology laboratory. The observation will reveal the action conformity as well as the environment in which the process has to be embedded. Furthermore it will establish an optimized workflow for a specific clinical environment to prepare the implementation of DP. Additionally it will be possible to
quantify digitized images in order to improve decision making and lastly to improve patient care. In the future it will be possible to extend automated image analysis in order to support clinical decision support. Depending on acceptance, this can lead towards an automated clinical decision support for cases with low complexity.
3D-Ultraschall beim MITK
(2017)
In dieser Bachelorthesis wird ein Frei-Hand-3D-Ultraschallsystem entwickelt. Dieses
soll 3D-Ultraschallbildgebung im MITK ermöglichen. Basis hierfür sind ein konventionelles
2D-Ultraschallgerät und ein optisches Trackingsystem. Die nötigen Teilschritte
werden erläutert und beschrieben.
Ergebnis ist ein Plugin für das MITK, das aus aufgenommenen 2D-Ultraschallbildern
ein 3D-Volumen berechnet.